Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cald1E9QA15 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms