Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdh18E9Q9Q6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms