Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TrdnE9Q9K5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms