Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gcom1E9PZ54 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms