Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms