Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930467E23RikD3Z1P8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms