Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms