Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Loxhd1C8YR32 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Loxhd1C8YR32 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms