Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms