Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CatipB9EKE5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CatipB9EKE5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms