Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Pdzd8B9EJ80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdzd8B9EJ80 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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