Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms