Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.4 ms