Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H60cB1B213 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms