Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc9bA3KGF9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms