Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6880A3KG45 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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