Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrg1A2BFE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrg1A2BFE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms