Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Upf2A2AT37 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms