Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pramef17A2ASJ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef17A2ASJ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms