Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms