Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem185aA2AF53 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem185aA2AF53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms