Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Myom3A2ABU4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myom3A2ABU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms