Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef6A2A8M8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms