Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrp1bA1Z198 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrp1bA1Z198 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms