Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4921501E09RikA0A0R4J054 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms