Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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