Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Speer3W4VSP1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer3W4VSP1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer3W4VSP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Speer3W4VSP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Speer3W4VSP1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms