Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfrp4Q9Z1N6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfrp4Q9Z1N6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms