Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0K8

Vnn1, Pantetheinase, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn1Q9Z0K8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vnn1Q9Z0K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Vnn1Q9Z0K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vnn1Q9Z0K8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vnn1Q9Z0K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Vnn1Q9Z0K8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vnn1Q9Z0K8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vnn1Q9Z0K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vnn1Q9Z0K8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms