Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AireQ9Z0E3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AireQ9Z0E3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AireQ9Z0E3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AireQ9Z0E3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AireQ9Z0E3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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