Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stxbp4Q9WV89 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Stxbp4Q9WV89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stxbp4Q9WV89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stxbp4Q9WV89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp4Q9WV89 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stxbp4Q9WV89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stxbp4Q9WV89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stxbp4Q9WV89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms