Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TapbpQ9R233 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TapbpQ9R233 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TapbpQ9R233 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TapbpQ9R233 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TapbpQ9R233 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TapbpQ9R233 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms