Protein–RNA interactions for Protein: Q9R190

Mta2, Metastasis-associated protein MTA2, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mta2Q9R190 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mta2Q9R190 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mta2Q9R190 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mta2Q9R190 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mta2Q9R190 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Mta2Q9R190 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mta2Q9R190 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mta2Q9R190 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mta2Q9R190 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms