Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N3

Syt11, Synaptotagmin-11, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt11Q9R0N3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syt11Q9R0N3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Syt11Q9R0N3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syt11Q9R0N3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syt11Q9R0N3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syt11Q9R0N3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt11Q9R0N3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt11Q9R0N3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt11Q9R0N3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms