Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd164Q9R0L9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd164Q9R0L9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd164Q9R0L9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd164Q9R0L9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cd164Q9R0L9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms