Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Lamc3Q9R0B6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lamc3Q9R0B6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lamc3Q9R0B6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lamc3Q9R0B6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Lamc3Q9R0B6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Lamc3Q9R0B6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Lamc3Q9R0B6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lamc3Q9R0B6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lamc3Q9R0B6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Lamc3Q9R0B6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Lamc3Q9R0B6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Lamc3Q9R0B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Lamc3Q9R0B6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Lamc3Q9R0B6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Lamc3Q9R0B6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Lamc3Q9R0B6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
Lamc3Q9R0B6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lamc3Q9R0B6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Lamc3Q9R0B6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
Lamc3Q9R0B6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Lamc3Q9R0B6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms