Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn2Q9R0A1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn2Q9R0A1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn2Q9R0A1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn2Q9R0A1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn2Q9R0A1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clcn2Q9R0A1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn2Q9R0A1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms