Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mid2Q9QUS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mid2Q9QUS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mid2Q9QUS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mid2Q9QUS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mid2Q9QUS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms