Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calm4Q9JM83 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calm4Q9JM83 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calm4Q9JM83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Calm4Q9JM83 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calm4Q9JM83 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calm4Q9JM83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calm4Q9JM83 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calm4Q9JM83 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms