Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nectin1Q9JKF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nectin1Q9JKF6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nectin1Q9JKF6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nectin1Q9JKF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nectin1Q9JKF6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nectin1Q9JKF6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nectin1Q9JKF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms