Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ybx3Q9JKB3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ybx3Q9JKB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ybx3Q9JKB3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ybx3Q9JKB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ybx3Q9JKB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ybx3Q9JKB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ybx3Q9JKB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ybx3Q9JKB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms