Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK38

Gnpnat1, Glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpnat1Q9JK38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnpnat1Q9JK38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gnpnat1Q9JK38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpnat1Q9JK38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpnat1Q9JK38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gnpnat1Q9JK38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpnat1Q9JK38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1302.1 ms