Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ddx20Q9JJY4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx20Q9JJY4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx20Q9JJY4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx20Q9JJY4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddx20Q9JJY4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ddx20Q9JJY4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx20Q9JJY4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddx20Q9JJY4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx20Q9JJY4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ddx20Q9JJY4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx20Q9JJY4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx20Q9JJY4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx20Q9JJY4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx20Q9JJY4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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