Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Htr3bQ9JHJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Htr3bQ9JHJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Htr3bQ9JHJ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Htr3bQ9JHJ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Htr3bQ9JHJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Htr3bQ9JHJ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htr3bQ9JHJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms