Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI0

Mmp19, Matrix metalloproteinase-19, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp19Q9JHI0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp19Q9JHI0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp19Q9JHI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp19Q9JHI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mmp19Q9JHI0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp19Q9JHI0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp19Q9JHI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms