Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcirg1Q9JHF5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcirg1Q9JHF5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcirg1Q9JHF5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcirg1Q9JHF5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcirg1Q9JHF5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcirg1Q9JHF5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms