Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn3Q9ES97 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn3Q9ES97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn3Q9ES97 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rtn3Q9ES97 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rtn3Q9ES97 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rtn3Q9ES97 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtn3Q9ES97 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rtn3Q9ES97 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn3Q9ES97 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtn3Q9ES97 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms