Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc4Q9ES56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc4Q9ES56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc4Q9ES56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc4Q9ES56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc4Q9ES56 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc4Q9ES56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms