Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Erg28Q9ERY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Erg28Q9ERY9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Erg28Q9ERY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Erg28Q9ERY9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erg28Q9ERY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms