Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slco1c1Q9ERB5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slco1c1Q9ERB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slco1c1Q9ERB5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slco1c1Q9ERB5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco1c1Q9ERB5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco1c1Q9ERB5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco1c1Q9ERB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms